黄巢见久攻陈州不下，乃发兵略邓、许、孟、洛，东入徐、兗数十州。正所谓‘久战之后必有饥荒。’时中原大饥，黄巢军缺粮，就以死人为食。赵犨乞兵太原。中和四年春，李克用率蕃汉之师五万，自泽州、潞州下天井关，借道河阳。昭义节度使孟方立写信给河阳节度使诸葛爽说：“李克用狼子野心，先占潞州，现又想图河阳，假道伐虢，轻小心之。”诸葛爽于是辞以河桥不完，拒绝借道给李克用，同时令大将刘经率精兵数万屯在边界。李克用知道诸葛爽不肯借道，怒报朝廷说：“诸葛爽拥兵自重，不肯借道，简直想谋造反。”昭宗见诸葛爽兵强马壮，不敢训斥，乃令李克用从他道而过。数日，李克用乃移军自河中南渡，趋汝州、洛阳。
唐僖宗任命时溥为东面兵马都统，诸葛爽为东南面招讨使，朱全忠为左金吾大将军、河中行营招讨副使，一起讨伐黄巢、秦宗权。黄巢遣秦宗权攻许州，秦宗权大将孙儒对秦宗权说：“听闻黄巢大军现在粮食已吃完，他现在令我们攻打许州就是想要许州城中的粮食，我们不能够养寇为患。”秦宗权然之，故意对许州围而不攻，黄巢军中粮食吃完，士兵们把附近木皮草根皆吃尽，士气大落。
朱全忠接到赵犨的求援信，见赵犨果勇，数败黄巢，心爱之，但是武宁节度使时溥却不将兵，迟迟不肯救援。朱全忠乃亲引大军前去支援陈州，同时请求时溥尽快发兵。
朱全忠与朝廷诸军会于陈之西北，武宁节度使时溥也领军一万五千到来，陈人望旗鼓出军纵火，急攻巢寨，黄巢下令死战，赵犨和赵昶领兵出击，黄巢与赵犨死战，尚让大战赵昶，无奈西北面朝廷大军压顶，黄巢军大乱，众大溃，黄巢与尚让落慌而逃，陈州重围遂解。朱全忠与赵犨领兵追砍三十里，黄巢军伏尸遍地。
回到陈州，赵犨兄弟对朱全忠等节度使下跪痛哭，感谢不已，朱全忠扶起赵犨说：“我们都是为朝廷效力，又是邻居，相互帮助是应该的。”朝廷闻捷，加赵犨遥领泰宁军节度，以赵昶为陈州刺史、检校右仆射。
中和四年三月，李克用率山西兵由陕济河而东，会关东诸镇壁汝州。黄巢令尚让率军三万驻扎在东面太康抵挡时溥，令黄思邺率军三万进驻西面西华抵挡诸葛爽，自己领众将扎营于瓦子堡敌朱全忠、赵犨。朱全忠和赵犨击瓦子堡，两军对垒，黄巢以剑指朱全忠大骂说：“朱温你这个叛徒，想我对你不薄，没想到你既然背叛我！”朱全忠大怒说：“黄巢老贼，我为你出生入死，每战最前，没想到你既然见死不救，你对我不仁，我也对你不义，今天别怪我。”两人于是领军冲杀，朱温一马当先连砍对方数将下马，赵犨兄弟也连挑数将，朱温舞着双刀直取黄巢，黄巢用剑抵挡，两人大战五十回合，黄巢不敌，策马先逃，官军斩首万馀级。李克用合朱全忠、时溥之师破尚让于太康，斩首亦万级，获械铠马羊万计。黄思邺和诸葛爽在西边对打，李克用领兵来援，又败黄思邺于西华，黄思邺夜遁，诸葛爽表李罕之为副使，令他屯兵宋州。黄巢大恐，居三日，军中相惊，弃壁垒走，巢退营故阳里，再建壁垒。
五月，大雨震电，川溪皆暴溢，壁垒尽坏，众溃，黄巢仰天长吼：“真是天亡我也!”解而去。朱全忠进戍尉氏，李克用追黄巢，朱全忠见自己也是出自农民军，于是想放黄巢一条生路，还汴州。黄巢很多部将投靠秦宗权，蔡州叛军势力日盛，招讨军无法取胜。诸葛爽任命李罕之为河南尹、东都留守。
黄巢取尉氏，攻中牟，来到王满渡，队伍刚刚渡河一半，李克用率领沙陀骑兵突然杀到，大击，众争渡，黄巢军多溺死。黄巢引残众走封丘，李克用追败之，还营郑州。黄巢涉汴河北引，夜复大雨，天空打雷闪电倾盘大雨，巢军惊溃，李克用闻之，急击巢军于河边。黄巢等众狼狈度河，大家恨不得多张两条腿。甩掉李克用后，黄巢怒对众将领说：“我等如此之狼狈皆朱温所赐，吾命令你们攻下汴州，诛杀叛徒朱温。”黄巢将士群情激愤，于是拼命向汴州杀去。朱全忠听闻黄巢来攻，亲自上城墙拒守，大齐将士舍生忘死的攀登攻城，朱全忠大惧，带领将士拼命砍杀抵挡。击退黄巢的进攻后，朱全忠问：“谁敢出去向司徒李克用搬救兵？”朱珍应声而出。朱全忠大喜，说：“汝带领所部杀出重围，不可与贼纠缠，立即向李克用求救。朱珍应诺，飞身上马，带领所部飞马杀出。黄巢正在安营扎寨休息，朱珍突然杀出，黄巢措手不及，连忙退却，朱珍杀开敌军向西奔去。
朱珍冲出汴城后，黄巢召集众将士说：“朱温派人出城，一定是去搬救兵，李谠、杨能何在？。”李谠、杨能连忙出列，朱温说：“你们两人带兵两万守住外围，有援军到来就给我痛击。”李谠、杨能领命。
三天后，朱珍和李克用率领骑兵到来，从后面就是一阵狂杀，李谠、杨能抵挡不住，巢军连忙令林言、黄揆领亲兵上前抵挡，朱全忠见援兵到来，大喜，领兵冲出，内外夹击，黄巢大败，巢令贼骁将李周、杨景彪等殿后，李周和杨景彪慌忙的拿刀提枪上前抵挡，战三十回合后，朱全忠与李克用斩双双斩李周和杨景彪于马下。
尚让以骁骑五千人至繁台，朱珍与庞师古、齐奉国等击退之。黄巢军夜走胙城，入冤句。李克用和朱全忠悉军穷